Ο Παναγιώτης Αγαπητός γεννήθηκε στην Αθήνα το 1959 και αποφοίτησε από την Γερμανική Σχολή το 1977. Σπούδασε Βυζαντινολογία και Μουσικολογία στο Μόναχο και, στη συνέχεια, Βυζαντινή Φιλολογία στη Βοστόνη το 1990.

Από το 1985 έως το 1989 δίδαξε Βυζαντινή και Νεοελληνική Φιλολογία στο Harvard University. Το 1992 έγινε επίκουρος καθηγητής της Βυζαντινής Φιλολογίας στο Πανεπιστήμιο Κύπρου και από το 2001 τακτικός.

Έχει δημοσιεύσει δύο μονογραφίες για τα βυζαντινά ερωτικά μυθιστορήματα, την κριτική έκδοση του δημώδους μυθιστορήματος Λίβιστρος και Ροδάμνη, όπως και σειρά άρθρων σχετικά με ερμηνευτικές προσεγγίσεις της βυζαντινής λογοτεχνίας, τη θεωρία της ρητορικής και τα λογοτεχνικά είδη στο Βυζάντιο, την ιστορία των χειρογράφων και τα προβλήματα κριτικής έκδοσης των μεσαιωνικών ελληνικών κειμένων. Η βυζαντινή ιστορία μυστηρίου “Το εβένινο λαούτο” είναι το πρώτο του μυθιστόρημα.

Είναι πρόεδρος της Byzantinist Society of Cyprus και ήταν επισκέπτης καθηγητής στο Freie Universitaet Berlin (1998), στην Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales (1999), και στο Stanford University (2009).